Costruttori di genoma?

• Aprile 25, 2024

Sedici anni fa il mondo ha incontrato il primo mammifero clonato: Dolly the sheep. Oltre lo stupore o la paura che ha causato al momento, ottenendo informazioni nel biologia molecolare Ha accelerato a un ritmo impressionante grazie allo sviluppo di nuove tecnologie, più efficiente, più veloce e più accessibile.

Ciò comporta un inconveniente: come analizzare e comprendere tutto quel mondo di dati e informazioni per rilevare e risolvere i problemi biologici? Nell'era del boom della costruzione del genoma, i ricercatori combinano i progressi delle scienze genomiche e delle macchine informatiche per creare database di informazioni biologiche in un libro elettronico.

Specialisti in genomica computazionale del Centro di scienze genomiche dell'UNAM guidare altri scienziati nelle profondità della natura di un organismo. La sua missione è assistere i ricercatori nello studio dei geni e dei genomi, oltre a modellare e prevedere i concetti di biologia, come il comportamento di una cellula.

Uno dei più grandi successi del team, guidato dal medico Julio Collado Vides , doveva ottenere la sequenza completa del genoma del batterio Escherichia colli, contributo pubblicato nel 1997 sul giornale scienza , uno dei più riconosciuti nel mondo scientifico. Ad oggi, il progetto centrale del gruppo è l'edizione del libro elettronico sulla fisiologia di questo e di altri batteri.

La genomica è lo studio della totalità delle proprietà del genoma: struttura, interazione e funzioni dei suoi componenti. Il genoma è il materiale genetico di un organismo e contiene tutte le informazioni necessarie per la creazione e lo sviluppo di quell'essere e il trasferimento delle sue caratteristiche di generazione in generazione.

La conoscenza derivata dalle scienze genomiche cresce di giorno in giorno. Solo circa 500 articoli scientifici all'anno sono generati intorno a Escherichia colli. "È l'organismo più conosciuto a livello molecolare. Da qui è nata la biologia molecolare ", afferma lo scienziato universitario.

Il gruppo di genomica computazionale esamina e conserva i dati raccolti nella letteratura scientifica, che saranno poi interpretati da altri ricercatori.

"Siamo curatori, leggiamo articoli e ricaviamo prove e scoperte, codificando tutte le informazioni in una struttura computazionale che ci consente di rappresentare i pezzi della cellula e le loro interazioni", sottolinea Julio Collado.

Altri scienziati hanno la responsabilità di comprendere il significato di questi dati e di trarre conclusioni, come spiegare perché gli umani e le mosche sono così diversi se il loro genoma coincide con il 60%; o perché diversi membri di una famiglia sviluppano determinati tipi di cancro.

Di fronte a questo panorama, Collado Vides si chiede quale sia il destino del batterio Escherichia colli, come un sottoinsieme di conoscenze biologiche che possono contribuire alla genomica del futuro. "Sappiamo molto di un singolo organismo che la sfida consiste nell'integrare tutte le conoscenze che gli scienziati generano per rappresentare la complessità biologica".

Con l'infrastruttura di primo livello del Computational Genomics Group, i suoi membri sviluppano metodi di previsione delle reti regolatorie, fattori di trascrizione e associazioni funzionali tra geni.

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